Nội dung cập nhật theo Nghị quyết 202/2025/QH15 và Nghị quyết 203/2025/QH15 sửa đổi Hiến pháp, áp dụng từ .
Thành phố Phúc Yên là đơn vị hành chính cấp huyện đã chấm dứt hoạt động từ ngày 01/7/2025 (ngày hoạt động cuối cùng là 29/6/2025), mã đơn vị hành chính 244. Toàn bộ đơn vị hành chính cấp huyện trên cả nước đều chấm dứt hoạt động cùng thời điểm này khi chính quyền địa phương chuyển sang mô hình 02 cấp. Trước sắp xếp, đơn vị này có 10 xã, phường, thị trấn trực thuộc.
Toàn bộ địa bàn của Thành phố Phúc Yên nay nằm trong 2 đơn vị hành chính cấp xã dưới đây.
Trước sắp xếp, Thành phố Phúc Yên có 10 đơn vị hành chính cấp xã. Bảng dưới đây đối chiếu từng đơn vị cũ với đơn vị hiện nay đã tiếp nhận địa bàn.
| Đơn vị cũ | Mã | Hiện nay thuộc |
|---|---|---|
| Xã Cao Minh | 08752 | Phường Xuân Hòa, Tỉnh Phú Thọ |
| Phường Đồng Xuân | 08747 | Phường Xuân Hòa, Tỉnh Phú Thọ |
| Phường Hai Bà Trưng | 08740 | Phường Phúc Yên, Tỉnh Phú Thọ |
| Phường Hùng Vương | 08737 | Phường Phúc Yên, Tỉnh Phú Thọ |
| Xã Nam Viêm | 08755 | Phường Phúc Yên, Tỉnh Phú Thọ |
| Xã Ngọc Thanh | 08749 | Phường Xuân Hòa, Tỉnh Phú Thọ |
| Phường Phúc Thắng | 08743 | Phường Phúc Yên, Tỉnh Phú Thọ |
| Xã Tiền Châu | 08758 | Phường Phúc Yên, Tỉnh Phú Thọ |
| Phường Trưng Trắc | 08734 | Chưa xác định |
| Phường Xuân Hoà | 08746 | Phường Xuân Hòa, Tỉnh Phú Thọ |